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人类靶基因预测及生物信息学分析
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摘要:微小RNA(miRNA) 是疾病发生发展过程中的调节剂,但其在炎症反应、免疫应答,特别是肿瘤中的调控机制仍然未知。本研究先对人类miR-146a-5p进行定位,分析序列保守性,挖掘其在不同组
微小RNA(miRNA) 是疾病发生发展过程中的调节剂,但其在炎症反应、免疫应答,特别是肿瘤中的调控机制仍然未知。本研究先对人类miR-146a-5p进行定位,分析序列保守性,挖掘其在不同组织中表达特征;同时,将、miRDB、mirDIP和DIANA TOOLS数据库预测的人类miR-146a-5p靶基因取交集,并通过构建了蛋白相互作用(PPI)网络;利用Omicshare平台和KOBAS数据库进行基因本体(GO)注释分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果显示:人类miR-146a-5p成熟序列的保守性高,推测其具有重要生物学功能;73个靶基因涉及到结构分子活性、催化活性以及转录因子活性配体的激活,并且参与机体代谢、信号传导、正负向调控等生物学过程;还与Toll样受体(TLRs)信号、核转录因子-κB(NF-κB)以及视黄酸诱导基因I样受体(RLRs)等相关信号通路相关联。本研究初步阐明了人类miR-146a-5p通过调控靶基因在肿瘤发生、免疫应答和炎症刺激等疾病发生发展过程起着重要作用,人类miR-146a-5p将可能成为潜在的生物标记物和治疗靶标。
文章来源:《人类学学报》 网址: http://www.rlxxb.cn/qikandaodu/2021/0314/595.html
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